Compute Module 3 (CM3) dựa trên Raspberry Pi 3 mới nhất có giá hợp lí và có hiệu suất làm việc cao hơn . Module này có cách sắp xếp tương tự kiểu SODIMM với chip xử lí 64-bit Broadcom BCM2837 4-lõi @ 1.2GHz ; 1GB RAM và lưu trữ 4GB eMMC .

Bên cạnh CM3 còn có Compute Module 3 Lite (CM3L) dùng cùng bộ vi xử lí  và 1GB RAM như CM3 nhưng không có lưu trữ eMMC cho phép người dùng lựa chọn giải pháp lưu trữ eMMC hoặc thẻ nhớ SD tùy biến .

Điều cần lưu ý đó là những module mới có hơn 1mm so với model ban đầu , thêm vào đó bộ vi xử lí  cần cường độ dòng điện tiêu hao lớn hơn nên có thể chạy nóng hơn trong những ứng dụng cần nhiều sức mạnh CPU nên tùy theo ứng dụng mà có thể dùng thêm những giải pháp làm mát .

Compute Module đầu tiên được phát hành hồi tháng 4/2014 và module mới lại dựa trên Raspberry Pi 3 mới nhất nên nhà sản xuất loại bỏ số 2 mà thay thế bằng tên gọi Compute Module 3 .

CM3 có giá 30$ , CM3L có giá 25$ .