Bình thường thì với những biến thể của Card màn hình khi phát hành hầu hết chỉ thay đổi bộ nhớ VRAM nhưng GTX1060 3GB có số lượng bộ nhớ giảm đi một nửa nhưng vẫn giũ nguyên bus nhớ 192-bit . Thêm vào đó NVIDIA cũng vô hiệu hóa 1 trong 10 SM trong GPU GP106 nên số lượng lõi CUDA giảm từ 1280 xuống còn 1152 , tương tự vậy số Texture Unit cũng giảm đi từ 80 xuống còn 72 .

GTX1060 3GB có tốc độ không thay đổi , 1506MHz / Boost 1709MHz , năng lực tính toán cũng bị giảm đi từ 4.4 xuống còn 3.9 TFLOPS . Mặc dù có số lõi CUDA giảm đi nhưng TDP của model 3GB vẫn duy trì ở 120W .

NVIDIA tuyên bố trong thế giới thực việc vô hiệu hóa 1 SM khiến cho GTX1060 3GB có hiệu suất làm việc giảm khoảng 5% trong khi đó giá lại giảm đi tới 50$ .

Mặc dù có hiệu suất làm việc giảm đi nhưng NVIDIA khẳng định nó là Card màn hình cạnh tranh cực tốt trong phân khúc thị trường 199$ . GTX1060 6GB có giá 249$ không cạnh tranh được với Radeon RX-480 4GB 199$ nếu tính theo tỉ lệ Giá / Tốc độ khung hình .